Applications of Hidden Markov Models (HMM) to annotate biological sequences [11 décembre 2019]

 Description

The last session of the course Computational biology (Master in Computatinal and Mathematical Biology).

Teacher: Jacques van Helden (https://orcid.org/0000-0002-8799-8584)

Contents: application of Hidden Markov models to annotate biological sequences

  1. Markov processes
  2. Modelling sequences with a m-th order Markov model
  3. Applications
    • Discrimination: classifying sequences as CpG islands or other region types
    • Segmentation: detecting CpG islands in the human genome

Mots clés : bioinformatics biological sequences discrimination hidden markov model segmentation

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